Branioci Željka Mejakića, Momčila Grubana i Duška Kneževića optuženih za zločine u prijedorskim logorima iznijele su Pred Apelacionim vijećem Suda BiH žalbe na prvostepenu presudu, zatraživši ponovno suđenje ili oslobađajuću presudu, saopšteno je iz Balkanske istraživačke mreže /BIRN/. Advokati optuženih naveli su da je „došlo do bitnih povreda krivičnog postupka, Krivičnog zakona BiH, te pogrešno i nepotpuno utvrđenog činjeničnog stanja, kao i visine krivičnopravne sankcije“, dok je Tužilaštvo istaklo da su žalbe „neosnovane“. Iznoseći usmeno žalbe pred Apelacionim vijećem, advokati optuženih su istakli da suđenje „nije bilo fer, pošteno i ravnopravno“. „Sud je jurio i tražio neku svoju istinu, a da pritom nije ni konfrontirao iskaze svjedoka, iako su međusobno imali potpuno različito mišljenje o događajima. Čini mi se da se ovdje zlonamjerno izvrtala istina i da su se određene stvari vadile iz konteksta“, rekao je Jovan Simić, advokat prvooptuženog Mejakića. Simić je dodao da je Sud zanemario činjenice da su „pojedini svjedoci Tužilaštva BiH priznali da su lagali na suđenju“, te da pri izricanju presude nije uvažio olakšavajuće okolnosti, kao što su „dobrovoljna predaja, narušeno zdravstveno stanje i svjedočenje prvooptuženog“. Tužilaštvo BiH je navelo da je prvostepeno vijeće „jasno i tačno“ u presudi obrazložilo učešće svakog optuženog pojedinačno, te da su žalbe branilaca „irelevantne“. Apelaciono vijeće dalo je rok braniocima optuženih da se do četvrtka, 19. februara, pismeno oglase u vezi sa odgovorom Tužilaštva BiH na njihove žalbe. Krajem maja 2008. godine, pred Sudom BiH Željko Mejakić nepravosnažno je osuđen na 21, Momčilo Gruban na 11 i Duško Knežević na 31 godinu zatvora zbog učešća u zločinima počinjenim nad nesrpskim stanovništvom u logorima Omarska i Keraterm.